هذا المختبر مزود بإمكانيات ومعدات مخبرية متطورة و باستفادته من تجارب خبراء من ذوي الخبرة في مجال الميكروبيولوجيا الغذائية فإنه يعمل في تنفيذ المشاريع البحثية، تقديم الخدمات المخبرية و تقديم الإستشارة للوحدات الصناعية و مؤسسات سيطرة الجودة و مراقبة الأغذية والتعاون في تنفيذ أطروحات طلاب الدراسات العليا فيما يتعلق بميكروبيولوجيا الأغذية، الآثار المضادة للميكروبات من الزيوت الاساسية و المستخلصات وغيرها.